截至年7月，甘南藏族自治州下辖合作市和临潭县、卓尼县、迭部县、舟曲县、夏河县、玛曲县、碌曲县七县一市。州人民政府驻地合作市人民街96号。
县级市
1.合作市
合作市地处青藏高原的东北端，甘、青、川三省交界处，是内地通往青海、西藏的交通要道，距省会兰州公里，全市总面积平方公里。合作市是甘南藏族自治州州府所在地，也是全州政治、经济、文化、科技和金融中心。
合作藏语音译为“黑错”，意为羚羊出没的地方。
县
2.夏河县
夏河县为甘肃省甘南藏族自治州下辖县，因境内大夏河得名。夏河县位于甘南州西北部，面积平方公里。境内著名景点有拉卜楞寺、桑科草原、达尔宗圣湖等。
3.碌曲县
碌曲县，隶属于甘肃省甘南藏族自治州，位于甘南藏族自治州西南部，青藏高原东边缘，甘、青、川三省交界处，总面积.6平方公里。
碌曲县的则岔石林是全县的三大著名旅游景区之一，也是甘南自治州乃至甘肃省著名的旅游胜地，年，则岔石林与尕海湖一起被列为国家级自然保护区。
4.玛曲县
玛曲县隶属甘肃甘南藏族自治州，位于甘肃省甘南藏族自治州西南部，青藏高原东端，甘、青、川三省交界处，黄河第一弯曲部，总面积是平方公里。
玛曲古属羌族地区，公元年吐蕃统一青藏高原后，才成为藏族的游牧之地。
5.迭部县
迭部县，甘肃省甘南藏族自治州辖县，地处秦岭西延岷、迭山山系之间的高山峡谷之中，青藏高原东部边缘甘川交界处，总面积.3平方千米。
迭部县古称“叠州”，藏语的意思是“大拇指”，被称为是山神“摁”开的地方。有红军长征中的“俄界会议”会址，茨日那毛主席旧居，天险腊子口战役等革命遗址。
6.舟曲县
舟曲县，隶属于甘肃省甘南藏族自治州，位于甘肃南部，甘南藏族自治州东南部，舟曲是藏语“龙江”之意，因白龙江穿县境而得名，面积平方公里。
舟曲县有“陇上桃花源”、“藏乡江南”之称，著名景点有甘肃舟曲特大山洪泥石流抢险救援纪念馆、拉尕山、沙滩国家森林公园、巴寨沟、赛尔布等。
7.临潭县
临潭县隶属甘南藏族自治州，古称洮州，位于甘肃省南部，甘南藏族自治州东部，临潭县总面积.68平方公里。
临潭县有国家AAAA级风景区冶力关、黄涧子国家级森林公园、莲花山国家级自然保护区，省级地质公园。
8.卓尼县
卓尼县，隶属于甘肃省甘南藏族自治州，甘肃省甘南藏族自治州东南部，全县总面积.68平方公里。著名景点有大峪沟、禅定寺等。
